Pokémon Rubí Omega y Pokémon Zafiro Alfa son los segundos juegos de la Sexta Generación de Pokémon. Se trata de los remakes de las Ediciones Rubí y Zafiro para Game Boy Advance, esta vez para la consola Nintendo 3DS. Como los juegos Pokémon X y Pokémon Y, sin embargo, sólo aprovechará las 3D en las batallas y algunos escenarios, dejando el mapeado principal en 2D.
En esta ocasión, sin embargo, deberemos enfrentarnos al poder de la Regresión Primigenia, una nueva forma de reacción en batalla similar a la Megaevolución que da lugar a Groudon Primigenio y Kyogre Primigenio. Además, nuestro personaje podrá acceder a las mega evoluciones conocidas y a nuevas mega evoluciones usando su Megapulsera.
Por supuesto, volverán los antiguos personajes y como no, el equipo Magma y el equipo Aqua dependiendo de la edición que juegues.